Full text data of TMCO1
TMCO1
[Confidence: medium (present in either hRBCD or BSc_CH or PM22954596)]
UniProt
J3QQY2
ID J3QQY2_HUMAN Unreviewed; 104 AA.
AC J3QQY2;
DT 03-OCT-2012, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT 03-OCT-2012, sequence version 1.
read moreDT 13-NOV-2013, entry version 9.
DE SubName: Full=Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 1;
DE SubName: Full=Transmembrane and coiled-coil domains 1, isoform CRA_c;
GN Name=TMCO1; ORFNames=hCG_1766418;
OS Homo sapiens (Human).
OC Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
OC Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
OC Catarrhini; Hominidae; Homo.
OX NCBI_TaxID=9606;
RN [1]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX PubMed=11181995; DOI=10.1126/science.1058040;
RA Venter J.C., Adams M.D., Myers E.W., Li P.W., Mural R.J., Sutton G.G.,
RA Smith H.O., Yandell M., Evans C.A., Holt R.A., Gocayne J.D.,
RA Amanatides P., Ballew R.M., Huson D.H., Wortman J.R., Zhang Q.,
RA Kodira C.D., Zheng X.H., Chen L., Skupski M., Subramanian G.,
RA Thomas P.D., Zhang J., Gabor Miklos G.L., Nelson C., Broder S.,
RA Clark A.G., Nadeau J., McKusick V.A., Zinder N., Levine A.J.,
RA Roberts R.J., Simon M., Slayman C., Hunkapiller M., Bolanos R.,
RA Delcher A., Dew I., Fasulo D., Flanigan M., Florea L., Halpern A.,
RA Hannenhalli S., Kravitz S., Levy S., Mobarry C., Reinert K.,
RA Remington K., Abu-Threideh J., Beasley E., Biddick K., Bonazzi V.,
RA Brandon R., Cargill M., Chandramouliswaran I., Charlab R.,
RA Chaturvedi K., Deng Z., Di Francesco V., Dunn P., Eilbeck K.,
RA Evangelista C., Gabrielian A.E., Gan W., Ge W., Gong F., Gu Z.,
RA Guan P., Heiman T.J., Higgins M.E., Ji R.R., Ke Z., Ketchum K.A.,
RA Lai Z., Lei Y., Li Z., Li J., Liang Y., Lin X., Lu F., Merkulov G.V.,
RA Milshina N., Moore H.M., Naik A.K., Narayan V.A., Neelam B.,
RA Nusskern D., Rusch D.B., Salzberg S., Shao W., Shue B., Sun J.,
RA Wang Z., Wang A., Wang X., Wang J., Wei M., Wides R., Xiao C., Yan C.,
RA Yao A., Ye J., Zhan M., Zhang W., Zhang H., Zhao Q., Zheng L.,
RA Zhong F., Zhong W., Zhu S., Zhao S., Gilbert D., Baumhueter S.,
RA Spier G., Carter C., Cravchik A., Woodage T., Ali F., An H., Awe A.,
RA Baldwin D., Baden H., Barnstead M., Barrow I., Beeson K., Busam D.,
RA Carver A., Center A., Cheng M.L., Curry L., Danaher S., Davenport L.,
RA Desilets R., Dietz S., Dodson K., Doup L., Ferriera S., Garg N.,
RA Gluecksmann A., Hart B., Haynes J., Haynes C., Heiner C., Hladun S.,
RA Hostin D., Houck J., Howland T., Ibegwam C., Johnson J., Kalush F.,
RA Kline L., Koduru S., Love A., Mann F., May D., McCawley S.,
RA McIntosh T., McMullen I., Moy M., Moy L., Murphy B., Nelson K.,
RA Pfannkoch C., Pratts E., Puri V., Qureshi H., Reardon M.,
RA Rodriguez R., Rogers Y.H., Romblad D., Ruhfel B., Scott R., Sitter C.,
RA Smallwood M., Stewart E., Strong R., Suh E., Thomas R., Tint N.N.,
RA Tse S., Vech C., Wang G., Wetter J., Williams S., Williams M.,
RA Windsor S., Winn-Deen E., Wolfe K., Zaveri J., Zaveri K., Abril J.F.,
RA Guigo R., Campbell M.J., Sjolander K.V., Karlak B., Kejariwal A.,
RA Mi H., Lazareva B., Hatton T., Narechania A., Diemer K.,
RA Muruganujan A., Guo N., Sato S., Bafna V., Istrail S., Lippert R.,
RA Schwartz R., Walenz B., Yooseph S., Allen D., Basu A., Baxendale J.,
RA Blick L., Caminha M., Carnes-Stine J., Caulk P., Chiang Y.H.,
RA Coyne M., Dahlke C., Mays A., Dombroski M., Donnelly M., Ely D.,
RA Esparham S., Fosler C., Gire H., Glanowski S., Glasser K., Glodek A.,
RA Gorokhov M., Graham K., Gropman B., Harris M., Heil J., Henderson S.,
RA Hoover J., Jennings D., Jordan C., Jordan J., Kasha J., Kagan L.,
RA Kraft C., Levitsky A., Lewis M., Liu X., Lopez J., Ma D., Majoros W.,
RA McDaniel J., Murphy S., Newman M., Nguyen T., Nguyen N., Nodell M.,
RA Pan S., Peck J., Peterson M., Rowe W., Sanders R., Scott J.,
RA Simpson M., Smith T., Sprague A., Stockwell T., Turner R., Venter E.,
RA Wang M., Wen M., Wu D., Wu M., Xia A., Zandieh A., Zhu X.;
RT "The sequence of the human genome.";
RL Science 291:1304-1351(2001).
RN [2]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Mural R.J., Istrail S., Sutton G., Florea L., Halpern A.L.,
RA Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R.,
RA Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V.,
RA Hannenhalli S., Turner R., Yooseph S., Lu F., Nusskern D.R.,
RA Shue B.C., Zheng X.H., Zhong F., Delcher A.L., Huson D.H.,
RA Kravitz S.A., Mouchard L., Reinert K., Remington K.A., Clark A.G.,
RA Waterman M.S., Eichler E.E., Adams M.D., Hunkapiller M.W., Myers E.W.,
RA Venter J.C.;
RL Submitted (JUL-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [3]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RX PubMed=16710414; DOI=10.1038/nature04727;
RA Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E., Kaul R., Swarbreck D.,
RA Dunham A., Scott C.E., Howe K.L., Woodfine K., Spencer C.C.,
RA Jones M.C., Gillson C., Searle S., Zhou Y., Kokocinski F.,
RA McDonald L., Evans R., Phillips K., Atkinson A., Cooper R., Jones C.,
RA Hall R.E., Andrews T.D., Lloyd C., Ainscough R., Almeida J.P.,
RA Ambrose K.D., Anderson F., Andrew R.W., Ashwell R.I., Aubin K.,
RA Babbage A.K., Bagguley C.L., Bailey J., Beasley H., Bethel G.,
RA Bird C.P., Bray-Allen S., Brown J.Y., Brown A.J., Buckley D.,
RA Burton J., Bye J., Carder C., Chapman J.C., Clark S.Y., Clarke G.,
RA Clee C., Cobley V., Collier R.E., Corby N., Coville G.J., Davies J.,
RA Deadman R., Dunn M., Earthrowl M., Ellington A.G., Errington H.,
RA Frankish A., Frankland J., French L., Garner P., Garnett J., Gay L.,
RA Ghori M.R., Gibson R., Gilby L.M., Gillett W., Glithero R.J.,
RA Grafham D.V., Griffiths C., Griffiths-Jones S., Grocock R.,
RA Hammond S., Harrison E.S., Hart E., Haugen E., Heath P.D., Holmes S.,
RA Holt K., Howden P.J., Hunt A.R., Hunt S.E., Hunter G., Isherwood J.,
RA James R., Johnson C., Johnson D., Joy A., Kay M., Kershaw J.K.,
RA Kibukawa M., Kimberley A.M., King A., Knights A.J., Lad H., Laird G.,
RA Lawlor S., Leongamornlert D.A., Lloyd D.M., Loveland J., Lovell J.,
RA Lush M.J., Lyne R., Martin S., Mashreghi-Mohammadi M., Matthews L.,
RA Matthews N.S., McLaren S., Milne S., Mistry S., Moore M.J.,
RA Nickerson T., O'Dell C.N., Oliver K., Palmeiri A., Palmer S.A.,
RA Parker A., Patel D., Pearce A.V., Peck A.I., Pelan S., Phelps K.,
RA Phillimore B.J., Plumb R., Rajan J., Raymond C., Rouse G.,
RA Saenphimmachak C., Sehra H.K., Sheridan E., Shownkeen R., Sims S.,
RA Skuce C.D., Smith M., Steward C., Subramanian S., Sycamore N.,
RA Tracey A., Tromans A., Van Helmond Z., Wall M., Wallis J.M., White S.,
RA Whitehead S.L., Wilkinson J.E., Willey D.L., Williams H., Wilming L.,
RA Wray P.W., Wu Z., Coulson A., Vaudin M., Sulston J.E., Durbin R.,
RA Hubbard T., Wooster R., Dunham I., Carter N.P., McVean G., Ross M.T.,
RA Harrow J., Olson M.V., Beck S., Rogers J., Bentley D.R., Banerjee R.,
RA Bryant S.P., Burford D.C., Burrill W.D., Clegg S.M., Dhami P.,
RA Dovey O., Faulkner L.M., Gribble S.M., Langford C.F., Pandian R.D.,
RA Porter K.M., Prigmore E.;
RT "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1.";
RL Nature 441:315-321(2006).
RN [4]
RP IDENTIFICATION.
RG Ensembl;
RL Submitted (AUG-2012) to UniProtKB.
CC -----------------------------------------------------------------------
CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms
CC Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License
CC -----------------------------------------------------------------------
DR EMBL; AL451074; -; NOT_ANNOTATED_CDS; Genomic_DNA.
DR EMBL; CH471067; EAW90764.1; -; Genomic_DNA.
DR UniGene; Hs.31498; -.
DR ProteinModelPortal; J3QQY2; -.
DR Ensembl; ENST00000464650; ENSP00000463951; ENSG00000143183.
DR Ensembl; ENST00000580248; ENSP00000462588; ENSG00000143183.
DR HGNC; HGNC:18188; TMCO1.
DR NextBio; 35536879; -.
DR ArrayExpress; J3QQY2; -.
DR GO; GO:0016021; C:integral to membrane; IEA:UniProtKB-KW.
DR InterPro; IPR002809; DUF106_TM.
DR InterPro; IPR008559; UCP023322_TM_euk.
DR PANTHER; PTHR20917; PTHR20917; 1.
DR Pfam; PF01956; DUF106; 1.
PE 2: Evidence at transcript level;
KW Complete proteome; Membrane; Reference proteome; Transmembrane.
SQ SEQUENCE 104 AA; 11372 MW; F3107F26F914ED83 CRC64;
MVRMKSMFAI GFCFTALMGM FNSIFDGRVV AKLPFTPLSY IQGLSHRNLL GDDTTDCSFI
FLYILCTMSI RQNIQKILGL APSRAATKQA GGFLGPPPPS GKFS
//
ID J3QQY2_HUMAN Unreviewed; 104 AA.
AC J3QQY2;
DT 03-OCT-2012, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT 03-OCT-2012, sequence version 1.
read moreDT 13-NOV-2013, entry version 9.
DE SubName: Full=Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 1;
DE SubName: Full=Transmembrane and coiled-coil domains 1, isoform CRA_c;
GN Name=TMCO1; ORFNames=hCG_1766418;
OS Homo sapiens (Human).
OC Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
OC Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
OC Catarrhini; Hominidae; Homo.
OX NCBI_TaxID=9606;
RN [1]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX PubMed=11181995; DOI=10.1126/science.1058040;
RA Venter J.C., Adams M.D., Myers E.W., Li P.W., Mural R.J., Sutton G.G.,
RA Smith H.O., Yandell M., Evans C.A., Holt R.A., Gocayne J.D.,
RA Amanatides P., Ballew R.M., Huson D.H., Wortman J.R., Zhang Q.,
RA Kodira C.D., Zheng X.H., Chen L., Skupski M., Subramanian G.,
RA Thomas P.D., Zhang J., Gabor Miklos G.L., Nelson C., Broder S.,
RA Clark A.G., Nadeau J., McKusick V.A., Zinder N., Levine A.J.,
RA Roberts R.J., Simon M., Slayman C., Hunkapiller M., Bolanos R.,
RA Delcher A., Dew I., Fasulo D., Flanigan M., Florea L., Halpern A.,
RA Hannenhalli S., Kravitz S., Levy S., Mobarry C., Reinert K.,
RA Remington K., Abu-Threideh J., Beasley E., Biddick K., Bonazzi V.,
RA Brandon R., Cargill M., Chandramouliswaran I., Charlab R.,
RA Chaturvedi K., Deng Z., Di Francesco V., Dunn P., Eilbeck K.,
RA Evangelista C., Gabrielian A.E., Gan W., Ge W., Gong F., Gu Z.,
RA Guan P., Heiman T.J., Higgins M.E., Ji R.R., Ke Z., Ketchum K.A.,
RA Lai Z., Lei Y., Li Z., Li J., Liang Y., Lin X., Lu F., Merkulov G.V.,
RA Milshina N., Moore H.M., Naik A.K., Narayan V.A., Neelam B.,
RA Nusskern D., Rusch D.B., Salzberg S., Shao W., Shue B., Sun J.,
RA Wang Z., Wang A., Wang X., Wang J., Wei M., Wides R., Xiao C., Yan C.,
RA Yao A., Ye J., Zhan M., Zhang W., Zhang H., Zhao Q., Zheng L.,
RA Zhong F., Zhong W., Zhu S., Zhao S., Gilbert D., Baumhueter S.,
RA Spier G., Carter C., Cravchik A., Woodage T., Ali F., An H., Awe A.,
RA Baldwin D., Baden H., Barnstead M., Barrow I., Beeson K., Busam D.,
RA Carver A., Center A., Cheng M.L., Curry L., Danaher S., Davenport L.,
RA Desilets R., Dietz S., Dodson K., Doup L., Ferriera S., Garg N.,
RA Gluecksmann A., Hart B., Haynes J., Haynes C., Heiner C., Hladun S.,
RA Hostin D., Houck J., Howland T., Ibegwam C., Johnson J., Kalush F.,
RA Kline L., Koduru S., Love A., Mann F., May D., McCawley S.,
RA McIntosh T., McMullen I., Moy M., Moy L., Murphy B., Nelson K.,
RA Pfannkoch C., Pratts E., Puri V., Qureshi H., Reardon M.,
RA Rodriguez R., Rogers Y.H., Romblad D., Ruhfel B., Scott R., Sitter C.,
RA Smallwood M., Stewart E., Strong R., Suh E., Thomas R., Tint N.N.,
RA Tse S., Vech C., Wang G., Wetter J., Williams S., Williams M.,
RA Windsor S., Winn-Deen E., Wolfe K., Zaveri J., Zaveri K., Abril J.F.,
RA Guigo R., Campbell M.J., Sjolander K.V., Karlak B., Kejariwal A.,
RA Mi H., Lazareva B., Hatton T., Narechania A., Diemer K.,
RA Muruganujan A., Guo N., Sato S., Bafna V., Istrail S., Lippert R.,
RA Schwartz R., Walenz B., Yooseph S., Allen D., Basu A., Baxendale J.,
RA Blick L., Caminha M., Carnes-Stine J., Caulk P., Chiang Y.H.,
RA Coyne M., Dahlke C., Mays A., Dombroski M., Donnelly M., Ely D.,
RA Esparham S., Fosler C., Gire H., Glanowski S., Glasser K., Glodek A.,
RA Gorokhov M., Graham K., Gropman B., Harris M., Heil J., Henderson S.,
RA Hoover J., Jennings D., Jordan C., Jordan J., Kasha J., Kagan L.,
RA Kraft C., Levitsky A., Lewis M., Liu X., Lopez J., Ma D., Majoros W.,
RA McDaniel J., Murphy S., Newman M., Nguyen T., Nguyen N., Nodell M.,
RA Pan S., Peck J., Peterson M., Rowe W., Sanders R., Scott J.,
RA Simpson M., Smith T., Sprague A., Stockwell T., Turner R., Venter E.,
RA Wang M., Wen M., Wu D., Wu M., Xia A., Zandieh A., Zhu X.;
RT "The sequence of the human genome.";
RL Science 291:1304-1351(2001).
RN [2]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Mural R.J., Istrail S., Sutton G., Florea L., Halpern A.L.,
RA Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R.,
RA Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V.,
RA Hannenhalli S., Turner R., Yooseph S., Lu F., Nusskern D.R.,
RA Shue B.C., Zheng X.H., Zhong F., Delcher A.L., Huson D.H.,
RA Kravitz S.A., Mouchard L., Reinert K., Remington K.A., Clark A.G.,
RA Waterman M.S., Eichler E.E., Adams M.D., Hunkapiller M.W., Myers E.W.,
RA Venter J.C.;
RL Submitted (JUL-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [3]
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RX PubMed=16710414; DOI=10.1038/nature04727;
RA Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E., Kaul R., Swarbreck D.,
RA Dunham A., Scott C.E., Howe K.L., Woodfine K., Spencer C.C.,
RA Jones M.C., Gillson C., Searle S., Zhou Y., Kokocinski F.,
RA McDonald L., Evans R., Phillips K., Atkinson A., Cooper R., Jones C.,
RA Hall R.E., Andrews T.D., Lloyd C., Ainscough R., Almeida J.P.,
RA Ambrose K.D., Anderson F., Andrew R.W., Ashwell R.I., Aubin K.,
RA Babbage A.K., Bagguley C.L., Bailey J., Beasley H., Bethel G.,
RA Bird C.P., Bray-Allen S., Brown J.Y., Brown A.J., Buckley D.,
RA Burton J., Bye J., Carder C., Chapman J.C., Clark S.Y., Clarke G.,
RA Clee C., Cobley V., Collier R.E., Corby N., Coville G.J., Davies J.,
RA Deadman R., Dunn M., Earthrowl M., Ellington A.G., Errington H.,
RA Frankish A., Frankland J., French L., Garner P., Garnett J., Gay L.,
RA Ghori M.R., Gibson R., Gilby L.M., Gillett W., Glithero R.J.,
RA Grafham D.V., Griffiths C., Griffiths-Jones S., Grocock R.,
RA Hammond S., Harrison E.S., Hart E., Haugen E., Heath P.D., Holmes S.,
RA Holt K., Howden P.J., Hunt A.R., Hunt S.E., Hunter G., Isherwood J.,
RA James R., Johnson C., Johnson D., Joy A., Kay M., Kershaw J.K.,
RA Kibukawa M., Kimberley A.M., King A., Knights A.J., Lad H., Laird G.,
RA Lawlor S., Leongamornlert D.A., Lloyd D.M., Loveland J., Lovell J.,
RA Lush M.J., Lyne R., Martin S., Mashreghi-Mohammadi M., Matthews L.,
RA Matthews N.S., McLaren S., Milne S., Mistry S., Moore M.J.,
RA Nickerson T., O'Dell C.N., Oliver K., Palmeiri A., Palmer S.A.,
RA Parker A., Patel D., Pearce A.V., Peck A.I., Pelan S., Phelps K.,
RA Phillimore B.J., Plumb R., Rajan J., Raymond C., Rouse G.,
RA Saenphimmachak C., Sehra H.K., Sheridan E., Shownkeen R., Sims S.,
RA Skuce C.D., Smith M., Steward C., Subramanian S., Sycamore N.,
RA Tracey A., Tromans A., Van Helmond Z., Wall M., Wallis J.M., White S.,
RA Whitehead S.L., Wilkinson J.E., Willey D.L., Williams H., Wilming L.,
RA Wray P.W., Wu Z., Coulson A., Vaudin M., Sulston J.E., Durbin R.,
RA Hubbard T., Wooster R., Dunham I., Carter N.P., McVean G., Ross M.T.,
RA Harrow J., Olson M.V., Beck S., Rogers J., Bentley D.R., Banerjee R.,
RA Bryant S.P., Burford D.C., Burrill W.D., Clegg S.M., Dhami P.,
RA Dovey O., Faulkner L.M., Gribble S.M., Langford C.F., Pandian R.D.,
RA Porter K.M., Prigmore E.;
RT "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1.";
RL Nature 441:315-321(2006).
RN [4]
RP IDENTIFICATION.
RG Ensembl;
RL Submitted (AUG-2012) to UniProtKB.
CC -----------------------------------------------------------------------
CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms
CC Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License
CC -----------------------------------------------------------------------
DR EMBL; AL451074; -; NOT_ANNOTATED_CDS; Genomic_DNA.
DR EMBL; CH471067; EAW90764.1; -; Genomic_DNA.
DR UniGene; Hs.31498; -.
DR ProteinModelPortal; J3QQY2; -.
DR Ensembl; ENST00000464650; ENSP00000463951; ENSG00000143183.
DR Ensembl; ENST00000580248; ENSP00000462588; ENSG00000143183.
DR HGNC; HGNC:18188; TMCO1.
DR NextBio; 35536879; -.
DR ArrayExpress; J3QQY2; -.
DR GO; GO:0016021; C:integral to membrane; IEA:UniProtKB-KW.
DR InterPro; IPR002809; DUF106_TM.
DR InterPro; IPR008559; UCP023322_TM_euk.
DR PANTHER; PTHR20917; PTHR20917; 1.
DR Pfam; PF01956; DUF106; 1.
PE 2: Evidence at transcript level;
KW Complete proteome; Membrane; Reference proteome; Transmembrane.
SQ SEQUENCE 104 AA; 11372 MW; F3107F26F914ED83 CRC64;
MVRMKSMFAI GFCFTALMGM FNSIFDGRVV AKLPFTPLSY IQGLSHRNLL GDDTTDCSFI
FLYILCTMSI RQNIQKILGL APSRAATKQA GGFLGPPPPS GKFS
//